Migren botoksu baş bölgesinde 7 bölgeye 31 enjeksiyon noktasından yapılır. İşlem ince uçlu iğnelerle yapılır ve etkisi 4-6 ay sürmektedir. Uzman bir nörolog hekim görüşü alınarak, ağrı yerine göre botoks enjeksiyonlarında gerekli bölgelere ek dozlar uygulanabilmekte ve başarılı sonuçlar alınarak migren kontrol altına alınabilmektedir.